GPNMB overexpression- a marker of resistance to CDK4/6 inhibitors
该研究通过构建药物耐受持久细胞模型并结合临床数据，发现 GPNMB 过表达是介导 ER 阳性乳腺癌对 CDK4/6 抑制剂（如阿贝西利）耐药的关键机制，提示其可作为预测患者疗效的潜在生物标志物和治疗靶点。
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cancer biology
411 篇论文
Longitudinal tumor ecosystem mapping defines glioblastoma treatment trajectories
该研究通过对 96 名患者的 671 对原发与复发性胶质母细胞瘤样本进行空间单细胞分析，绘制了肿瘤生态系统的演化轨迹，揭示了五种与临床预后及治疗反应密切相关的独特亚型，为胶质母细胞瘤的预后分层和个性化治疗提供了新框架。
Co-evolution of Oncogenic KRAS Signaling and LILRBhigh Macrophages Drives Pancreatic Cancer Recurrence
该研究通过整合多组学临床数据与功能实验，揭示了胰腺癌复发由 KRAS 信号增强与 LILRB4 高表达巨噬细胞协同进化驱动，并证实靶向该轴可显著抑制肿瘤进展。
Driving proteomic imbalance in malignancy provokes proteomic catastrophe and confers tumor suppression
该研究揭示热休克因子 1（HSF1）通过维持癌症蛋白质组稳态以支持肿瘤生长，而诱导其缺失可引发蛋白质组灾难性失衡及淀粉样变，从而在神经纤维瘤病 I 型相关肿瘤和黑色素瘤中实现肿瘤抑制，为抗癌治疗提供了新策略。
Engineered subtilisin protease degrades active KRAS in cancer cells, leading to differential cell targeting
该研究展示了一种工程化蛋白酶（RASp）能够特异性切割并降解癌症细胞中处于激活状态的 KRAS 蛋白，从而阻断下游 MEK-ERK 信号通路并选择性诱导 KRAS 依赖性癌细胞死亡。
Saturating hepatic clearance drives elevated cfDNA and fragment shortening in cancer
该研究通过机制模型与临床数据分析证明，癌症患者中 cfDNA 浓度升高及片段缩短的现象主要由肝脏清除机制饱和所致，而非单纯源于肿瘤负荷，这一发现将癌症相关的片段组学特征重新定义为清除动力学受损的系统性后果。
Patient-derived organoids from malignant pleural effusion to explore for alternative therapies in thoracic tumors
该研究证实了从恶性胸腔积液成功构建患者来源类器官的可行性，并展示了其在肺癌和恶性胸膜间皮瘤化疗敏感性个体化评估中的转化潜力。
Single-Cell Transcriptomic Signatures Enable Stratified Combination Therapy for Platinum-Resistant Ovarian Cancer
该研究利用 54 名患者 72 个样本的单细胞转录组数据，构建了以卡铂为核心的耐药机制解析框架，通过整合多维药物筛选资源并经由类器官及体内模型验证，成功鉴定出针对铂耐药高级别浆液性卵巢癌的个性化联合治疗策略。
Pathway incompatibility between NF-κB and RAS signaling constrains oncogenicity in B-cell leukemia
该研究揭示了在 B 细胞急性淋巴细胞白血病中，经典 NF-κB 信号通路的激活会诱导细胞向成熟 BCR 阳性状态转变，从而与致癌性 RAS 信号产生发育背景依赖性的互斥作用并抑制肿瘤发生，阐明了通路不相容性作为限制致癌信号活性的关键机制。
Oncogene inactivation-induced senescence facilitates tumor relapse
该研究揭示了致癌基因失活诱导的细胞衰老（OIIS）是一把双刃剑，它虽能暂时抑制肿瘤生长，却通过重塑肿瘤微环境及促使残留细胞获得基因组不稳定性等适应性改变，最终导致肿瘤复发。
A high-throughput 3D culture microfluidic platform for multi-parameter phenotypic and omics profiling of patient-derived organoids
该研究开发了一种基于 384 孔板的高通量微流控平台（MPO），实现了患者来源类器官的微型化培养与多参数表型及组学分析，不仅验证了其在临床治疗预测中的价值，还揭示了 EZH2 抑制剂可预防转移性结肠癌对 RAS 抑制剂产生耐药性的新机制。
Palbociclib CDK4/6- and Crizotinib MET/ALK/ROS1-inhibitors Synergize to Enhance Senescence and Immune Recognition in Melanoma Cells Independently of BRAF/NRAS Status
该研究证实，联合使用 CDK4/6 抑制剂帕博西尼（palbociclib）与 MET/ALK/ROS1 抑制剂克唑替尼（crizotinib）可独立于 BRAF/NRAS 突变状态，通过协同诱导黑色素瘤细胞衰老并增强免疫识别，从而激活抗肿瘤免疫反应以抑制肿瘤生长。
Assessing the Operational Feasibility of Evolutionary Therapy in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer
该研究通过基于 START-TKI 临床试验数据的虚拟患者模型，评估了测量误差、预约延迟等临床现实因素对转移性非小细胞肺癌进化疗法可行性的影响，发现单约束方案比双约束方案更具鲁棒性，且动态调整的治疗方案虽有益但需严格随访，从而为未来临床试验设计与临床实施提供了重要依据。
Proteome landscape of B-cell malignancies identifies mantle cell lymphoma protein signature
该研究通过定量蛋白质组学分析，鉴定出 10 种在套细胞淋巴瘤中特异性上调且常被转录组分析忽略的蛋白质，为开发新型靶向治疗和 CAR-T 细胞疗法提供了关键依据。
Convergent stromal and immune remodeling defines spatial tumor dynamics in PARP inhibitor-resistant high-grade serous ovarian cancer
该研究通过整合空间转录组学技术，揭示了 PARP 抑制剂耐药性在高级别浆液性卵巢癌中伴随着缺氧相关恶性程序激活、基质区室化增强及效应免疫细胞排斥等可重复的空间微环境重塑特征。
Deoxysphingolipids activate cGAS-STING1 and enhance antitumor immunity
该研究发现，通过增加结肠癌细胞中的脱氧鞘脂（deoxySLs）水平可诱导线粒体应激并释放双链 DNA，进而激活 cGAS-STING1 通路，最终增强抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤生长。
Targeting ALC1 can safely expand the therapeutic utility of PARP inhibitors across high-grade serous ovarian cancers
该研究证明，靶向染色质重塑酶 ALC1 不仅能克服同源重组缺陷及 CCNE1 扩增型卵巢癌对 PARP 抑制剂的耐药性，还能通过磷化 RPA2 水平预测安全性，从而在正常细胞毒性极低的前提下显著扩大 PARP 抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中的治疗适用范围。
A bivalent lysine-acetylated small-molecule binding site in MYC
该研究揭示了一个由 MYC 蛋白 bHLH 结构域与延伸的 MYC Box II（eMBII）共同构成的双价小分子结合位点，并发现 eMBII 中关键赖氨酸 K148 的乙酰化不仅增强了该区域的有序性和小分子抑制剂的结合亲和力，还实现了对致癌性乙酰化 MYC 的选择性靶向。
Focused Ultrasound Thermal Ablation and CD40 Agonism Reprograms Breast Tumor Immunity to Drive Regression and Memory
该研究证明，聚焦超声热消融（T-FUS）与 CD40 激动剂联用能通过诱导免疫原性细胞死亡和重塑肿瘤微环境，在多种乳腺癌模型中驱动 T 细胞依赖的肿瘤消退并建立持久的免疫记忆，为对免疫检查点抑制剂耐药的乳腺癌提供了一种具有临床转化潜力的原位疫苗策略。
Identifying cancer cell-state transitions from multimodal single-cell data
该研究提出了一种利用 mRNA 与蛋白积累时间差来捕捉癌症细胞表型转换的单细胞分析框架，通过整合多组学数据与 CRISPR 筛选揭示了驱动可塑性的分子机制，并构建了具有广泛预后价值的评分系统以量化肿瘤可塑性。